Священномученик Никодим – один из сонма святых новомучеников и исповедников Церкви Русской.
Священномучеником Никодимом были составлены две молитвы святителю Иоасафу Белгородскому, а также большой труд «Житие, прославление и чудеса святителя Иоасафа». Под руководством епископа Никодима и при его непосредственном участии были изданы тома, связанные с деятельностью святителя Иоасафа, в Свято-Троицком мужском монастыре воссозданы его покои, музей святителя Иоасафа, обладавший обширным фондом документов.
После Октябрьского переворота владыка Никодим не побоялся открыто встать на защиту Православия.
7 января 1919 года, в праздник Рождества Христова, он был арестован ЧК. По просьбе верующих, требовавших отпустить владыку, местные чекисты «освободили» его на один день, а просивших за него — арестовали. На следующие сутки епископ был повторно арестован и вскоре также расстрелян.
Тело епископа было брошено в общую могилу. Ежедневно возле этой могилы служились панихиды. После прихода в Белгород Белой армии его мощи были перенесены в Свято-Троицкий мужской монастырь и погребены близ раки святителя Иоасафа Белгородского.
Определением Архиерейского Собора Русской Православной Церкви от 13-16 августа 2000 года он был причислен к лику святых новомучеников и исповедников Российских.
2 ноября 2012 года в Белгороде был найден склеп с останками православного иерарха, предположительно принадлежащими священномученику Никодиму, обнаруженный при строительстве здания Белгородской митрополии на Свято-Троицком бульваре.
После проведения идентификации останков Патриарх Московский и всея Руси Кирилл определил: «Найденные останки признать мощами священномученика Никодима (Кононова), епископа Белгородского. Внести в месяцеслов Русской Православной Церкви дату обретения мощей священномученика Никодима 20 октября / 2 ноября 2012 года».
Стоит отметить, что в дни пребывания в уральской столице мощей священномученика Никодима, столь много сделавшего для прославления святителя Иоасафа Белгородского, в Екатеринбурге на Лесном кладбище 24 сентября состоится освящение храма в честь этого великого белгородского святителя.