В 2010 году во время своего первого Первосвятительского визита в Екатеринбургскую Епархию Святейший Владыка совершил в монастыре молебен святым Царственным страстотерпцам у поклонного креста, воздвигнутого над шахтой, куда цареубийцы бросили тела убиенных.
Святейший Патриарх ознакомился с архитектурным комплексом монастыря и посетил главный храм обители в честь святых Царственных страстотерпцев, возведенный на месте, где в июле 1918 года огнем и серной кислотой были уничтожены тела членов Царской семьи и их верных слуг.
В дар главному храму обители Святейший Патриарх Кирилл передал образ Спасителя.
Исторически, Ганина Яма – это заброшенный рудник в нескольких километрах от Екатеринбурга. В середине XIX века этот участок земли был приобретен с целью добычи золота подрядчиком Гавриилом, от прозвища которого и произошел по всей видимости топоним «Ганина Яма». Стоит заметить, что золото здесь так и не нашли, зато активно добывали железную руду до XX века. Позже рудник был полностью заброшен, шахты оказались заваленными.
Именно на это место в ночь с 16 на 17 июля 1918 года были вывезены и сброшены в шахту останки царя Николая и его семьи.
Почитание мученического подвига Царя Николая II, Царицы Александры Федоровны, Цесаревича Алексия, Царевен Ольги, Татианы, Марии и Анастасии началось задолго до их прославления. В 1991 году архиепископ Мелхиседек благословил установить Поклонный крест в урочище Ганина Яма на месте уничтожения останков Царской Семьи. 23 сентября 2000 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II посетил это святое место и благословил создание монастыря во имя Святых Царственных Страстотерпцев.
Основные труды по строительство монастыря, начатые архиепископом Екатеринбургским и Верхотурским Викентием, взяла на себя Уральская Горно-Металлургическая компания под руководством Андрея Анатольевича Козицына. Благодаря молитвенной помощи братии Троице-Сергиевой Лавры и духовника Лавры архимандрита Кирилла (Павлова), молитвами православных Екатеринбургской Епархии, за три года было построено семь храмов.
Первой в монастыре встречает паломников «Вратарница», образ Иверской иконы Божией Матери, благословляющий православных и ограждающих их от бед и напастей. Икона расположена на внешней стороне надвратного храма, освященного в Ее честь. Иверскую икону Божией Матери особенно почитали русские самодержцы. Каждый свой въезд в Москву они начинали с молитвы перед этим образом, расположенным в часовне около Красной площади Кремля. Сама же чудотворная Иверская икона хранится в одном из монастырей Святой горы Афон. Афонским обителям оказывали свою поддержку Российские Государи, особенно Император Николай II.
Первый монастырский храм, освященный во имя Святых Царственных Страстотерпцев, воздвигнут около той самой «открытой шахты», рядом с которой в июле 1918 года уничтожались честные останки Августейших Страдальцев и их верных слуг. У самой шахты установлен поклонный крест, а в Царском храме хранится принадлежавший Царской Семье крест-мощевик с частицами от Древа Животворящего Креста Господня, от риз Господа Иисуса Христа и Божией Матери, мощей сорока угодников Божиих. Эта святыня была передана в дар монастырю и торжественно доставлена в обитель крестным ходом 19 мая 2001 года в день рождения Царя Страстотерпца Николая II. От креста-мощевика отмечены различные случаи чудотворений и исцелений.
Рядом с храмом Царственных Страстотерпцев расположен храм в честь иконы Божией Матери «Державная», явленной 2/15 марта 1917 года. Сама Пречистая Богоматерь взяла Отечество наше под Свой благодатный Покров. В 2010 году в результате пожара Державный храм был почти полностью уничтожен. Сейчас идут работы по восстановлению утраченной святыни.
Святителю Николаю, Мир Ликийскому Чудотворцу, ставшему «русским святым» в сознании народа, посвящен один из самых красивых храмов в монастыре. Святитель Николай – небесный покровитель Царя Страстотерпца. В этом храме хранится небольшая икона Святителя Николая, принадлежавшая Царской семье, переданная в дар монастырю. Здесь же хранится икона святителя, написанная специально для храма Николая Чудотворца и освященная на мощах святого в городе Бари (Италия), и икона Георгия Победоносца, написанная на Святой горе Афон.
Два храма монастыря посвящены великим молитвенникам за Русскую Землю – преподобным Серафиму Саровскому и Сергию Радонежскому, которых особенно чтила Царская Семья. Преподобный Серафим Саровский был прославлен в 1903 году благодаря усердию и настойчивости Императора Николая II. Храм во имя этого святого угодника Божия небольшой по размерам, но удивительно уютный. Под ним устроен нижний придел в честь иконы Божией Матери «Умиление», келейной иконы преподобного.
Преподобный Серафим Саровский пророчествовал: «Будет Царь, который меня прославит, после чего будет Великая Смута на Руси, много крови потечет за то, что восстанут против этого Царя. Ангелы не будут успевать брать души, все восставшие погибнут, а Бог Царя возвеличит…»
Всех подходящих к храму во имя преподобного Сергия Радонежского, встречает икона с изображением «игумена земли Русской», расположенная на алтарной стене. Преподобный, поучая братию, жившую с ним, говорил: «аще приступаете работати Господу, уготови душу во искушение. Ибо многими скорбями подобает внити в Царствие Божие». В храме пребывает написанный в Троице-Сергиевой Лавре образ Святых Царственных Страстотерпцев.
За шахтой располагается храм во имя праведного Иова Многострадального. Последний Российский Император Николай II родился в день памяти святого праведного Иова Многострадального. Глубоко верующий человек – Царь Страстотерпец всегда был убежден, что это совпадение не случайно. Многие его современники утверждали, что Император Николай II предчувствовал трагическое будущее России и мученичество своей семьи, но по примеру Иова Многострадального готовился встретить его по-христиански, с верою в Господа
Именно в монастырь святых Царственных страстотерпцев ежегодно в ночь с 16 на 17 июля после Божественной Литургии в Храме-на-Крови направляется многотысячный «Царский» крестный ход.